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苏格兰折耳猫的祖先是农场猫，它继承了祖先的勤劳，它有很强的环境适应能力，同时它的抗病性也较强。但是由于体内生长基因的变化和遗传学等问题，都可能会导致苏格兰折耳猫出现遗传疾病。

一、体质较弱

父辈们的身体就娇弱，因此受到遗传的影响，诞生的下一代折耳猫身体也会非常的虚弱。病猫的体型及体重只有正常猫的2/3，同时由于抵抗力弱就更易感染猫瘟，皮肤病，过敏等后天产生的疾病了。

二、呼吸系统毛病

由于骨骼病变的基因，除了影响手脚的骨骼外，也会影响猫咪身体其它部分软骨组织发育异常。较常见的是呼吸管道收窄引起呼吸不顺畅，严重者需要以外科手术来扩宽呼吸管道。此外会有喷鼻血的问题，不过成因暂时未明因此没有方法可以进行有效的医治。

三、心脏病

心肌肥大症也是常见于折耳猫身上，不过一般是很难发现，直到出现病症时，已有生命危险，猫咪需要控制饮食和终生服药。心脏病对折耳猫的影响非常的沿严重，稍有照顾不周，就会威胁苏格兰折耳猫的生命。

四、骨骼遗传病

1.四肢关节肿胀，指甲生长异常。

2.后肢过短，有不寻常的弯曲、增生物或肿块。

3.尾巴又粗又短、僵硬、不能屈曲，有些病猫的尾巴是不能摆动的。

4.后脚掌异常肥厚，若细心观察，当猫咪坐直时，后脚掌的枕肉是触不到地面的。

对苏格兰折耳猫的遗传病，有些目前还没有有效的治疗方法。因此，为了减少遗传病对折耳猫的伤害，在配种繁殖的时候就要进行严格的筛选和把关，让新诞生的苏格兰折耳猫都有一个强健的体魄，可以成长为美丽迷人的猫咪。