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最初的临床检查包括仔细的外生殖器检查，可能会发现极少见的机械性障碍，如永存性阴茎系带及阴茎毛环，这种状态下公 猫通常对母猫还有性欲，会有骑乘的动作，但感觉上似乎不太愿意交配。

配种障碍较有可能的原因为对母猫失去性欲，已往能成功地育种的公猫突然失去了性欲，最重要的两个因素是心理因素及紧迫因素。公猫在自己熟悉的环境内（ 或笼子 ）通常都能展现强势的配种能力，百战百胜，无攻不克，一旦转换了环境，在陌生的环境中性欲就可能被抑制了，一旦适应了新环境之后则又能一展雄风了。

有的年轻公猫将第一次给了一只凶恶的母猫，特别是配种后会狂怒地攻击公猫的母猫，可能会使得这只公猫失去性欲，从此不近女色，而治疗的方法就是挑选一只温驯且合作的发情母猫来鼓励交配，或许可以让它重拾一点男性尊严。

在配种管理上最常发生的问题就让公猫冒然地与发情母猫共处一笼，猫咪跟人类一样须要谈谈小恋爱的，如果突然让它们共处一笼，母猫可能会激烈反抗，并可能会攻击公猫，让公猫的尊严受损，最好是能将母猫及公猫各自放在两个相连的笼子内，让母猫慢慢缓和情绪，逐渐适应公猫的存在，之后母猫就可能会开始勾引公猫，做出很多妩媚挑逗公猫的动作，这时就可以让它们进入洞房了，剎那间天雷勾动地火，配种的成功率就会大增的。

另外也必须注意配种笼的大小，太小的笼子不但会让公猫无法施展，也会在配种成功之后使得公猫无处逃窜，而惨遭母猫无情的海扁。

波斯品种的公猫有的甚至要到2岁才会达到性成熟，而单独饲养的公猫也会有延迟性成熟的现象，因此一只没有育种经验的配种障碍公猫，可能只是尚未到达性成熟而已，而延迟性成熟的公猫可与多只母猫一起饲养来刺激性成熟。先天性雄性素不足也会引起性欲的丧失，而正常公猫的血清雄性素浓度则尚未有一套标准值，因此增添了诊断上的困难。

染色体的异常也可能引起繁殖障碍，但很少发生，像龟甲波斯的公猫即是一种染色体异常而引起繁殖障碍的病例。

要探讨一只公猫不育的原因之前，应该先确定它已经与多只种用母猫（ 已被证实具有生育能力的母猫 ）交配过而无怀孕现象，并且已排除任何管理上的问题，而交配动作上也没有任何的疑问，配种的母猫应于交配后数日监测血清助孕素浓度来确认已有排卵。

精虫品质不良是公猫不育最有可能的解释，公猫在采精须要特别的专门技术，临床上的检查有实际的困难，大部份的人认为精虫品质不良的公猫其睪丸会较小，且坚实度异常，但经由触诊的评估较不客观且不准确。