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随着城区的扩大和城市人口的增加，宠物犬猫的数量也急剧增多，随之而来则是大街小巷的宠物诊所和宠物商店的兴起。然而，相当多的基层兽医由于对犬猫的生理生化特点不了解，因而在临床用药时往往出问题。

胃肠道和非胃肠道注射部位的药物吸收与其配方有关。通常犬猫的吸收是相同的，但猫对于高度脂溶性药物经皮肤吸收率可能更快些。

犬猫在通过某些代谢途径排除药物的能力上具有显著差异。葡萄糖醛酸化物的合成是动物排多种药物的一种重要代谢途径。猫相对缺乏肝脏微粒体葡萄糖醛酸基转酶活性。因此，通过这种途径代谢的药物排除的速度较慢，用药时应注意避免毒性作用。

对于药物的肾脏排泄，犬和猫相同。都可能通过尿液排出药物，这两种动物都可按每千克体重相同的剂量给药。没标出具体动物的则为犬猫共用的剂量（标出犬或猫的则为单项动物的）。

犬品种繁多，作为一种普遍规律，对于大型品种总用药物量应根据建议的剂量范围的低限计算。水杨酸可卡因类如阿斯匹林可引起胃溃疡，尤其是高剂量时。四环素类抗生素，如果用于妊娠动物可引起后代牙齿着色，对于幼犬施用四环素类抗生素亦可引起同样的后果。磺胺类如柳氮磺胺吡啶，如果是全身性施用，可引起干性角膜结膜炎，强化后的磺胺类药可在德国品种多伯曼猎犬中引起免疫介导性多关节炎。酚噻嗪，如乙酰丙嗪，对于短头品种可能引起自发性昏厥，使用时应谨慎。巴比妥酸可卡因，如硫喷妥钠，在猎犬中由于重新布入脂肪组织的能力有限，而可能延长其在这些品种体内作用。

药物的佐药也有一些在犬猫品种中引起不良反应。聚乙二醇35蓖麻油的一种增溶成分可在犬中释放组织胺和类组织胺物质，因此该制剂不能用于犬。

用于猫的药有其特定的问题。有些药物在肝脏中与葡萄糖醛酸甙结合，如有机磷化合物、阿斯匹林、氯霉素、苯妥英和灰黄霉素应避免使用或慎用。防腐剂和消毒剂如碘酊及其衍生物、苯甲酸苄酯、苯酚和甲酚，对猫尤其具有毒性。这是由于猫本身有修饰毛的习惯，以致吃入过多药物所致。鸦片类镇痛药，包括吗啡、丁啡喃、杜冷丁衍化物，如苯乙哌啶氢氧化物，大剂量使用可引起强烈的极度兴奋。酚噻嗪类药物如乙酰丙嗪，对有些猫可引起极度兴奋，甲苯噻嗪对狗和猫可引起呕吐，可用于催吐。氨基甙系抗生素，如庆大霉素、链霉素和新霉素对猫尤有毒性，可产生耳毒和肾毒，或对两者均有毒害，因而在临床上应慎用或不用。

胃复安常在临床上用于动物的止吐，然而剂量稍大则可引起犬猫胃的强烈痉挛甚至胃出血和死亡，在临床应用时应严格把握剂量。