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将3个或3个以上品种或群体的性状通过杂交重组在一起，培育出新品种的方法，称为复合杂交育种。金鱼中一些名贵品种就是以多个品种的性状通过杂交，使基因重组在一起而形成的。

金鱼饲养者常常利用两个甚至三四个不同品种的金鱼相互杂交，使各个品种的特征集中在新产生的子代上，进而培育新品种。如红龙睛球金鱼是龙睛金鱼与绒球杂交而重组形成的；红龙睛高头绒球金鱼是龙眼、鹅头(肉瘤)和绒球3种性状结合而成的，而红龙睛高头翻鳃绒球是龙眼、鹅头、翻鳃和绒球4种性状结合在一起而形成的。