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活性碳放在水草缸的过滤器内，主要优点是可以吸附色素，使水质看起来不会泛黄，也可以吸附一些溶解性有机质，对水体的氧化还原电位（ORP）的改善有助益，另外，它也可能成为硝化细菌附着的基质，对硝化系统的运作应该会有一些帮助。

主要缺点是它会大量吸收二氧化碳，可能会影响水草光合作用的效率，或造成二氧化碳的浪费，并加速它吸附作用的丧失。有人说它会吸附水草肥料，这种说法并不正确。总的来说，如果水质清澈，有定期局部换水，最好不必在水草缸的过滤器内布置活性碳。