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水草遭到病菌感染的原因及途径如下：

1. 病原的入侵：大多数的病原，都是由外界转移进来的，如新买回来的水草，生物或投喂生饵‧‧‧等都可能夹带病原进入 水族箱。  

2. 寻找寄生水草：病原会由水草表皮、水草上的伤口侵入水草体内。且伤口是许多病原入侵水草的必须途径，且伤口会提供营养质加速病菌的生长。

3. 水草产生病征：水草感染病源后，未必会立刻发病，有些会先有一段潜伏期，才会出现病征。有的病原会吸收水草的营养，或干扰水草细胞的活动，使水草产生化、叶斑或腐烂等症状。

4. 病原的散布：病原在水箱中的散布方式，通常是由发病的植株将病原散布出来，形成新的感染原。