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金头闭壳龟为1988年由中学教师罗碧涛、上海自然博物馆宗瑜以安徽南陵的标本发表的新种。发现初期除徐州师范大学邹寿昌、安徽师范大学聂刘旺、黄山学院唐鑫生、上海养龟爱好者陆伟等收集了一些活体外，没有引起足够重视，大量个体捕捉后除本地人食用玩赏外主要去往华东地区的食物和花鸟市场，包括黄山屯溪公园、上海江阴路、杭州岳王庙、徐州等地，市场价仅几十元。

1991年以后徐州师范大学开始进行相关研究，并初步确定泾县古坝、蔡村、孤峰为主要分布地，其调查时野外捕捉数量已十分稀少，每年仅收购到3只左右。1992年安徽省将其列入省一级保护动物。九十中期以后，开始有人去往产地搜集。南京龟鳖博物馆周婷等人开始不断出版有关龟类饲养的科普书籍，国内龟鳖爱好者群体不断扩大，陆伟等人也在人工饲养条件下繁殖子一代成功。

1997年的中国濒危动物红皮书评估为极危级。1998年以来，国内刮起了一股搜集饲养稀有闭壳龟类的狂潮，日本、美国、港台的科学家和爱好者也不惜重金相求，金头闭壳龟价格一路上扬，产地也有人频繁前往。与此同时，安徽师范大学、南京师范大学等单位开始利用手中的金头闭壳龟进行了一些遗传学和分子系统学研究。

2000年以后，该龟的野外情况进一步告急，IUCN红色名录评估为极危级，CITES公约把其列入附录II。安徽师范大学的张方、吴孝兵，黄山学院的唐鑫生等人在经费紧张的情况下开始进行较深入的野外研究，进一步确定了该龟在安徽泾县和黟县的分布和现状，部分了解了其野外生态，澄清了以往的一些错误认识。人工饲养也有了进一步的发展，湖北武穴、江苏无锡等地的养殖场初步建立了繁殖种群。