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成年的绿树蟒体长平均约有90至120厘米，最高纪录为213厘米。它们的上唇鳞片位置，有一双具备耐热功能的凹槽。绿树蟒一如其名，其身体颜色是鲜明的绿色，沿着脊柱位置有一条蓝色条纹，周身零星分布白色或黄色的鳞片。也有部分产地的绿树蟒背部中央只有黄、白色鳞片组成的线条。幼体绿树蟒主要有淡黄、鲜红和砖红几种颜色。淡黄的个体背部有黑色为主的条纹,夹杂白斑;鲜红和砖红的个体背部条纹为白色为主,夹杂黑斑。同一窝孵化的绿树蟒幼体,可能同时出现各种颜色。幼体绿树蟒一般在出生后几个月至几年间,变换为成体的绿色调为主体色。个别产地的绿树蟒,成体后仍然会保持淡黄色的体色。这种绿树蟒一般被称为金丝雀(canary),而受到爬虫饲养者们的推崇。绿树蟒身上偶尔也会出现蓝化现象，蓝色绿树蟒更加罕见和珍贵。

绿树蟒与一般树蟒一样，保持栖息于树木之上。它们会以身体环绕树枝往来回蜷，最后把头部垂在正中间位置，远看形状就像一个马鞍。这个独特的栖息姿态，与隶属蚺科并分布于南美洲的翡翠树蚺几乎是一样的，由于二者不论是外型还是栖息动作都如此相似，因此经常令人产生混淆。绿树蟒上唇的热窝较少, 集中于上唇前方, 而不像翡翠树蚺遍布整个上唇. 而且头部前方的鳞片也很细小, 不像翡翠树蚺存在较大的鳞片. 另外一个就是生殖方式(绿树蟒为卵生, 而翡翠树蚺则是卵胎生)。