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硝化细菌俗称：A菌、硝化菌。水族箱中如果没有它的存在，随着水族生物（爱罗等）生命的代谢活动，必然会面临氨和亚硝酸含量的激增的危险，亚硝酸对于鱼来说是有害的，这是因为亚硝酸与一些金属离子结合以后可以形成亚硝酸盐，而亚硝酸盐又可以和胺类物质结合，形成具有强烈致癌作用的亚硝胺，而氨气则直接可以伤害鱼类的呼吸体统。不论您采用何种方法或任何水族用品用品都不能彻底解决这个问题，当水中的氨和亚硝酸的浓度达到水族生物致命浓度时，对于任何一种水族生物而言，结果可能都是一样的--那就是死亡。而硝化细菌的在氮循环水质净化过程中扮演着重要的角色。

硝化细菌包括两个细菌亚群，一类是亚硝酸细菌（又称氨氧化菌），将氨氧化成亚硝酸，消除水中生态系统中氨对水族生物的危害。另一类是硝酸细菌（又称硝化细菌），将亚硝酸氧化成硝酸。这两类菌能分别从以上氧化过程中获得生长所需要的能量，但其能量利用率不高，故生长较缓慢，其平均代时（即细菌繁殖一代所需要的时间）在10小时以上。这两类菌通常生活在一起，这样便避免了氨和亚硝酸盐的积累，水中的氨或铵盐必需在以上两类细菌的共同作用下才能转变为硝酸盐。两类菌均为专性好气菌，在氧化过程中均以氧作为最终电子受体。

硝化细菌包括亚硝化菌和硝化菌，时至今日，人们尚未发现一种硝化细菌能够直接把氨转变成硝酸，进而消除因水中鱼类代谢产生的氨、亚硝酸盐类对其的伤害，所以说，硝化作用必须通过这两类菌的共同作用才能完成。亚硝化菌包括亚硝化单胞菌属、亚硝化球菌属、亚硝化螺菌属和亚硝化叶菌属中的细菌。硝化菌包括硝化杆菌属、硝化球菌属和硝化囊菌属中的细菌。

十分严格：前者只能利用氨；后者只能利用亚硝酸。亚硝化菌的代谢产物是亚硝酸，亚硝酸是硝化菌进行同化作用所必需的能源物质。所以如果用硝化细菌等微生物“开缸”时，最好也要提供适量、足够的“能源物质“，比如加入所谓的闯缸鱼就是让其提供硝化细菌的能源物质，使其迅速的繁殖起来而发挥作用。