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水草缸的使用水，一般以自来水、山泉水、河川水为来源。欲将原水注入水缸前如未将浮游于水中的藻类或孢仔杀灭，而直接注入水草缸中，藻类孢仔由于水缸中的光源配合养分的吸收而繁殖，导致水质混浊绿色化或黄褐化。倘不幸注入的水中含有多量具有毒性的藻类，则会导致鱼虾、水中生物致死，但不自知者比比皆是。

清晰与混浊在水草缸中，水草、鱼虾、微生物三者是相互共存的，当生态达到良好的平衡状态时，水质则呈现闪烁的透明水。

水草缸水质混浊常是由以下原因造成的：

在旧水缸水质产生变化，或新设缸生态尚未健全时，易发生水质混浊；或鱼饲料的投入超量，沉淀腐败有机物及细菌在突然间增多时，原来水缸中正常量的微生物群一时无法分解过多的有机物，而使得水质恶化，导致水质混浊。严重时尚带有异味散发于空气中。白浊的水质通常出现在初设缸时，一般多是因为原生动物的繁殖，造成水质白浊，但也有少部分是因为使用砂石中所含石灰质造成的白浊现象。

生物性的白浊发生原因初设缸的鱼饲料投入过剩，过滤器内的硝化菌稀少，在同一时间内无法分解多量的有机物，引起剩余有机物的超量现象，使以有机物为食物的浮游生物繁殖，当浮游生物繁殖多量时，捕食浮游生物的原生动物就出现，当原生动物的繁殖数量多，整缸的原生动物所呈现的就是白浊的水色，此乃导致水质白浊的因素。

另外，附著于砂粒中的浮游生物遇水後即大量繁殖，因而捕食此浮游生物的原生动物会大量繁殖，也是造成水质混浊的原因。

其他如；生鲜冷冻的红蚯蚓、活水蚤或活丝蚯蚓等，未经消毒就予以投饵入缸，所带入之浮游生物繁殖，造成原生动物数量增多，亦为混浊原因之一。

解决对策发生因生物性引起的白浊水质时，我们可以参考以下的解决方法：

1、投入EM群，以分解水中的有机物，转换为水草养分（生物法）。

2、过滤器内装置吸著力强的过滤棉（如羊毛绒、极细孔泡棉、木碳粉块＼包等）以快速吸附水中的有机物。最好的方法为借重水槽生态良好的过滤器（过滤材中附著众多的有益微生物）效果更佳（生物法＋物理法）。

3、投入酵素于水中。可迅速分解水中有机物，消除後，使水中浮游生物无法生存而减少，配合有益硝化菌繁殖时，水质就会澄清。（水质澄清剂有EM、酵素、粒子结合凝结沉淀剂等之分，请勿混淆）

4、水质严重恶臭时，以臭氧（O3）打气，将沼气氧化，使恶臭消除并且杀菌，可使水质澄清。

5、UV杀菌：放入缸中的鱼体附著的纤毛虫大量繁殖所引起的水质混浊，除了勤于换水外，可用水族用紫外线杀菌灯，将水中纤毛虫、浮游生物杀灭，使水质澄清。（物理法）

6.水质混浊期间，别忘勤于换水为上策。