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它是利用微生物方法去除水族箱中硝酸盐的一种过滤装置。它将水族箱中的硝酸盐还原成氧气和氮气，使水族箱中的硝酸盐降至尢害的量级。

它的工作原理是利用一种去硝微生物，将硝酸盐作为它代谢中的需氧物质，将NO3最终代谢成N2和CO2，氧被用于代谢过程，N2被排入到大气中，代谢的生成物为CO2。在去硝器中填充着生物球，为避免积水产生水滞区由水泵将水从容器底部抽吸到顶部然后又散于生物球的表面，再流回到底部始终使生化球表面保持湿润状态。

去硝微生物在潮湿的环境中不断的吸取氧气繁殖生长，先将容器中的氧用完，然后就改用N0离子中的氧气，将NO3还原成NO2最后将NO2中的氧全部取去，被还原成N2排入大气中。在这个过程中使水中的氧化还原电位不断下降，从正值降到负值。可以从氧化还原电位中判断出去硝的程度。由于去硝器中水是在没有溶氧的状态下硝酸盐被还原成氮、还原反应是主导的，故它的氧化还原电位很低，是-50mv～-250mv。

在高于-50mv 时，去硝反应会停留在亚硝酸盐阶段。在-30m时所有的硝酸盐已全部被还原，于是去硝的微生物细菌就会取用硫酸盐的氧，产生H2S。所以当氧化还原电位指示其电位值不到-50mv甚至是正值，就要停止水族箱的水流入去硝器或增加去硝微生物菌的投放量。当电位低于-300mv，就要增加水流量减少或停止投放微生物菌。我们必须密切注意去硝器的氧化还原电位变化才能保证去硝器的正常工作。