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      细菌在水族箱水质处理上有什么用？这些水中细菌所扮演的角色有:1物质的循环2水质管理3影响鱼只的生理健康等几个主要的方向。
　　（1）物质的循环 这方面是水质管理方面最重要的一环！主要的是“含碳化合物”的物质循环！残留在水中的含碳化合物以可溶性的物质和分溶性的颗粒存在着。水中的细菌会将这些有机物来利用供其生长繁殖所需的营养。这些增长的细菌，有机会凝聚之后成为水中大型生物的饵料，再次成为其他水生生物营养。在大自然界中，细菌所扮演的（分解者）角色，在 水族箱中也充分地发挥其天赋的责任。一方面将大分子的颗粒转换成为小分子的物质。另一方面将其转换为身体的一部份。除此之处，在代谢过程中放出水和二氧化碳，也会直接出现在水生环境中，供绿色植物行光合作用（photosynthesis） 时所需。 在一些强调“生态平衡”的水族箱中，这类的物质循环必须相当有效率，如此才有办法将不断引入水族箱中的营养固定在生物体中。也有很大的机会将溶解在水中的含碳有机物，经由细菌和微小生物的捕食关系，再次地被鱼儿吃到肚子里去，许多会翻捡水族箱底部砂石的鱼类，在吃食相同的饲料却会长得比较快的原因，就是在翻捡过程中，可以补多余的营养。而这些营养方面的聚集，都是这类细菌有相当密切的相连性。
　　（2） 水质管理 这方面的问题也是多所讨论的话题，常见的文章中都以硝化细菌中的“硝酸菌（Nitrate bacteria;Nitrosomonas）”和“亚硝酸菌（Nitrate bacteria;Nrtrify bacter）”所主导的“硝化作用（Nitrfication）”为重心，强调的是水中“氨氧”的物质循环，如何将毒性较高的氨氮转换为毒性较低的亚硝酸和硝酸，甚或直接将氨氮转换为细菌生长所需的氨氮来源。此外，能处理硫化氢的光合菌（photosynthesis bacteria ）也常常被提及。虽然水族箱中不见得有其发挥作用的无氧环境，却也能在处理有机废物上发挥一些作用。适当的数量存在时，对处理水中的有毒物质有很大的帮助，但是，突然大量存在时，对鱼体本身来说也不是一件好事。最基本的是会抢掉相当多的氧气，短时间之内会造成鱼儿因缺氧而大量死亡。当然，对鱼体的皮膜组织也有一些侵犯性，在看待这些“绵羊”时，也不妨将之当作是披着羊皮的狼！ 另外在此需要强调的，水族箱中如果存在过多的水中悬浮有机物，会提供细菌大量繁殖机会。尤其是过多的饲料残留物及分解之后生物尸体常常会溶出相当多的营养物质，提供给细菌生长所需。再者，鱼只死亡之后会释出相当多的“游离氨基酸（Free amino acid）”，这些氨基酸往往是促进病原菌大量繁殖的促进因子。这也是喂食“汉堡”等非熟化生鲜饵料的水族箱中，会发现相当多的病原细菌的缘故。所以，必须以过滤效果较佳的过滤器，将水中过多的悬浮有机颗粒过滤除。而一旦发现水中有死亡的鱼体，也要马上将其移除。反观一些有益的细菌，就能有效率地将这些营养物质消化利用，一方面减少水中的有机物含量，另一方面也能避免其它的细菌（尤其是致病菌）利用于生长和繁殖。
　　（3） 影响鱼类的生理健康 这是一般讨论鱼病方面问题的文章所锁定的重点。当这些会影响鱼类生命健康情况的细菌出现在水族箱的时候，一般来说，还是得先和原有的细菌竞争生存空间（营养方面大致不会缺乏，因为水族箱的水质一直都是相当富有营养的水体），不论是在水中，滤材表面或是鱼体内外，都必须有原有的细菌做一番竞争，而输赢并不是以病原性的有无为取决点，而是其他的竞争能力来决胜负。换句话说，这是一场细菌间的战争，也是一场肉眼无法看见的战争。只有在分出胜负之后，水质或鱼儿的健康情况显现出来，才知道输赢。 在环境条件的配合之下，病原细菌开始站稳脚跟，并且开始大量繁殖。这些数量暴增的细菌开始分泌毒素或侵犯鱼体的细胞，使得鱼儿的身体欠安。
　　这方面的例子，以鱼类消化道中的细菌竞争最为典型。当原本生存在消化道中的细菌群被其他外来的细菌群所取代之后，鱼只的消化情况就会出现问题，轻则食欲不振，重则消瘦之后逐渐死亡。其他例如“柱状菌（Cytophaga colunnaris）”和“嗜水性梭孢杆菌（Aeromonas hydrophilus）”等细菌，也会在其他方面造成许多鱼体的生理病变。相对的，当水中生存空间一旦被一些非致病细菌所占领，而这些细菌都具有强大的竞争能力时（甚或会杀除或抑制其他特定病原细菌的生存），则对鱼儿的身体健康有相当大的帮助。例如：杆菌中的“枯草杆菌（Bacillus subtilis）”和乳杆菌中的“双叉乳酸杆菌（Lactobacillus bifidus）”等的细菌，都是常被提到的。而这些细菌在市面上已有相当普遍的应用层面，常被水族爱好者添加入水族箱中。 维持水中的“细菌相”平衡或是保留有益（至少无害）的细菌，去除会致病的细菌，一直都是水族专家所努力的目标。除了日常的水族保养，添加有益的细菌之外，当移入新的鱼和水草时，一定要做好事先的消毒工作，能有效地防止未知的病原细菌移入水族箱中，此外，留心些微的鱼体变化，也是可以观察得出来水中细菌种类和数量变动的情况。总而言之，虽然细菌看不见，却也不能完全无法可管地任其为所欲为，不是吗？