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正如前面所说的，过滤材料中生长有大量的硝化细菌群落，滤棉、陶瓷环以及其它您所使用的多孔材料是数以百万计的细菌的聚集场所。

有时您的过滤系统会因为碎石或者其它微小颗粒(比如食物，细沙等)造成阻塞。这可以通过过滤器的出水口的流量减小来判断(如果出水口是设置在水面就很容易察觉出来，而这种设置是一种较实用的做法)，这时就必须采取措施了。

您可以拔下过滤器并将阻塞物清除出去，同时更换全部滤材，这样做可以确保您的过滤器的流量保持原来的状态，但却犯了一个错误。因为您已经把数以百万计的有益细菌也全部丢弃了，这样您将您的缸置于危险之中。而只有残存的一小部分有益细菌(在底沙、玻璃、植物等其它任何地方)可以进行硝化作用了，而这时鱼儿的数量还是不变的。在此情形下，硝化细菌必须重新生长，直到可以重新承载全部鱼儿的正常生存。这种情况最终常常会导致“新缸症状”的出现。更槽糕的是，因为您的缸不是新缸，鱼儿的数量是满负荷的，要恢复正常状态需要一个较长的时间，而实际情况往往导致问题迅速恶化。

因此，如果您需要更换滤材，避免一次全部更换，应保留一部分。如果缸中有两个过滤器(作者通常同时使用六个以上)，您可一将其中一半的过滤器的滤材彻底更换，等2~3周之后再更换另一半过滤器的滤材。如果您只使用单个过滤器，您应该用缸里的陈水轻柔地清理滤材然后重新将这些滤材放回到过滤器中。请不要用自来水清洗，因为自来水中的氯会杀死硝化细菌。

记住只能使用缸中的陈水或者是经过除氯的熟水。为安全起见，最好使用两个以上的过滤器。