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在分类系统上，一般主要根据成虫翅的脉序、连锁方式和触角的类型等特征，将鳞翅目分为轭翅亚目、僵翅亚目和锤角亚目3个亚目。

也有的学者(O．W．Richards乙．R．G．Davies，1977)主张分为小翅蛾亚目、蝙蝠蛾亚目、毛顶蛾亚目、单孔亚目和双孔亚目5个亚目。至于总科和科的建立，意见也不很一致，如有的主张分为28个总科、158科，有的则分为20个总科、135科等。