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蜜柑大实蝇在日本九州一年发生1代，以蛹在土中越冬。一般于6月上旬初开始羽化，直至7月下旬末，6—8月都能见到成虫。幼虫脱果始期在10月下旬，少数可延至次年1月上、中旬。

由于蛹越冬场所处的位置不同，接受阳光而获得的温度高低有异，因此成虫羽化时期有先后，一般以向阳地的蛹羽化最早，故此虫的羽化期一般认为可达2个月。成虫羽化以上午10—12时最多，午后羽化较少。羽化时刻与天气有关，晴天午前多，阴天次之，雨天午后多。成虫的产卵前期17—26天，于7月中旬开始交尾产卵，盛期于8月上旬。成虫产卵通常在一个产卵孔中1粒。