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发病初期，染病的幼虫由于得不到足够的食物，便改变了在巢房中的正常位置，随后很快死亡，虫体变松软并腐烂、呈褐色，放出酸臭的气味，但有的可能只有少许臭味或没有臭味。

患病幼虫在腐败之前，在解剖镜下可以很容易地用镊子沿着虫体的中线把表皮分开剥去，中肠的内容物留在围食膜中，里面充满灰白色的细菌凝块。健康幼虫的中肠肠壁和其内容物是不容易分离的，而且呈金褐色。

蜂群染上欧洲幼虫病后，轻者有百分之3至百分之5的幼虫死亡，重者有百分之20至百分之25或更多的幼虫死亡。检查蜂群时，可发现“插花子脾”。

健康的蜜蜂幼虫体色应为珍珠白色，并有光泽和明显的环纹，若染上欧洲幼虫病则变为黄色或暗褐色、环纹模糊或消失。

欧洲幼虫病严重的蜂群，幼虫的腐烂物也像死于美洲幼虫病的幼虫那样“拉丝”，但是拉得比较短、粗并且容易断。

除了对症状的观察分析，最简单的诊断方法是作涂片镜检：将病死幼虫的户骸或死虫体液置于干净的载玻片上，加一滴无菌水后用玻璃棒研磨出混悬液，再加入一滴百分之10苯胺黑染色液后混匀，以另一载玻片的边缘扒抹成薄涂片，干燥后，用油镜头观察，只要能看见到披针形、成群分布的蜂房链球菌，即可确诊为欧洲幼虫腐烂病。