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兔子的均衡饮食，指的是营养和消化时间的均衡。这包含了一些比较慢才能消化的物质，像是蛋白质、淀粉、碳水化合物、维他命和矿物质，同时也包含了大量不能消化，但能快速通过肠胃的有机物质。还有一件要知道的事，就是去推断可消化和不可消化的物质的比例，找出最适合兔子的量。

肌肉的收缩以一种绕圈的方式来挤压并搅拌食物，分开不同大小的微粒，同时将它们与胃液混合。胃本身包括俩个部分，胃底并不具有分泌的作用。幽门区所分泌的包括盐酸、消化酵素和黏液。胃所扮演的角色是个贮存器官，并将消化物推送到小肠。

当食糜离开胃后，胰脏和肝胆所制造的酵素就会分泌到小肠的十二指肠中。主要的消化作用发生在小肠之中；果糖、大部分的淀粉，和百分之九十以上的蛋白质在此被吸收，但是纤维质在这里却不能有效地消化。小肠表面有很多微小的突起物，称之为绒毛，作用是增加大量的吸收面积。小肠有三个作用区：十二指肠是中和胃酸和混合消化物的主要部位，胰脏的酵素分泌到此，混合碳水化合物、蛋白质、脂肪和肝的胆酸，对于维生素和脂肪的吸收很重要；空肠是消化和吸收的主要部位；最后一段是回肠，黏膜下有淋巴结。

纤维会被分成大和小的微粒，大微粒被移除，小微粒则送到盲肠进行发酵作用。这些消化物会均匀的从回盲交接处回肠末端，再被排出。细微粒物质被盲肠袋有选择性的分散，当大微粒物质以粪便颗粒的形态传到大肠时，环状肌肉纤维则以反向的方式将消化物移到盲肠。细菌会消化小肠内的纤维质(小微粒)、大部分的糖类、多余的淀粉以及任何剩余且未消化的蛋白质，产生综合维生素B群和挥发性脂肪酸，直接从血液被吸收。盲肠是结肠的盲端，内容积为胃的二到三倍，藉由不断的蠕动，盲肠以前后收缩的方式快速混合消化物。消化物不断的在盲肠和近端结肠之间进出。盲肠内含共生细菌，可以产生纤维分解酵素，而分解植物细胞的纤维。阑尾会分泌碱性的液体，以中和盲肠发酵时所产生的挥发性脂肪酸。

未被消化的纤维和废物(硬的粪便颗粒)以富含维生素的盲肠便形态移到大肠(软的盲肠便)，这是由盲肠里的发酵物质形成的。和普通粪便比起来，盲肠便含有较多的蛋白质和水分，而纤维量较低。近端结肠会弯向胃的方向，以分段的收缩方式将消化物分成粪便颗粒。远程结肠和胃在同一高度，形成环状向后到直肠。兔子会从肛门将盲肠便直接吃掉，再度回到消化系统里。盲肠便有黏膜包着保护，在胃里继续发酵数小时，直到移到小肠营养被吸收为止。