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医疗设备是动物医院服务的硬件，与医疗水平和能力息息相关。

条件好的动物医院应当有化验设备，诊疗设备，消毒设备，严格无菌的手术室，治疗设备，病理检查设备，病原分离培养设备、动物尸体无害化处理设备和通讯与管理设备。

化验设备是在化验室，由血球自动分析仪、血液生化仪、尿液自动分析仪、血尿离子分析仪、血气分析仪、血球计数器、显微镜、冰箱和离心机等组成。

条件更好的动物医院（如：中国农业大学动物医院）的化验设备还有：超净工作台、真菌分离培养设施、细菌分离培养设备、病毒分离培养设备。

诊断设备包括：眼科检眼镜、检耳镜、心电图仪、自动监护仪、Ｘ光机、自动洗片机、透视仪、Ｂ超仪、胃窥镜、结肠镜、关节镜等。当然，国外的最好的动物医院还有CT机和核磁共振仪。

治疗设备包括：符合无菌条件标准的手术室、无影灯、一定数量的手术器械、手术台、针灸治疗仪器、理疗仪、输液泵等。