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斑马鱼的雌雄不难区分：雄斑马鱼鱼体修长，鳍大，体色偏黄，臀鳍呈棕黄色，条纹显着；雌鱼鱼体较肥大，体色较淡，偏蓝，臀鳍呈淡黄色，怀卵期鱼腹膨大明显。

斑马鱼属卵生鱼类，4月龄进入性成熟期，一般用5月龄鱼繁殖较好。斑马鱼的繁殖周期约7天左右，一年可连续繁殖6—7次，而且产卵量高。

斑马鱼的繁殖比较容易。繁殖用水要求pH6.5-7.5，硬度6-8，水温25-26摄氏度。由于斑马的卵为无粘性的沉性卵，并且斑马鱼和其他鲤科鱼一样会吃掉自己的卵。所以大家应该在繁殖缸底铺设一些可以将卵隐蔽起来的物品。笔者以前是将玻璃弹球（也就是小孩子玩的玻璃球）密密的在缸底铺上一层，这样卵会从玻璃球的空隙落到繁殖缸底部，玻璃球可以将亲鱼和卵分开以免亲鱼吃掉卵。另外，还可以用玻璃作出一个一个格子，放到繁殖缸里，每一格约10×10cm，这样就可以将多对亲鱼放到一起产卵。然后同时孵化，幼鱼也可以同时喂养和管理了。

繁殖时可按雌雄鱼1:2的比例防入繁殖缸内，一般头天晚上防入，第二天上午或中午就可以产卵受精。排完卵要将种鱼捞出另养。一条雌鱼每次可排卵300-1000粒不等。受精卵经2-3天可孵出仔鱼，再经2天仔鱼开始游动觅食，开始先以“洄水”喂之，10天后可改喂其他小型鱼虫。