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瑶山蜥为卵胎生爬行动物，体近圆柱状略扁，头似蜥蜴，躯体、棱脊、尾部则似鳄鱼，长约20—30厘米，四肢粗壮有力，体背深褐黑略带黄色，腹部蛋黄色带棕色或橙黄色，鳞片光滑。

瑶山蜥适生于大山小冲沟中;喜栖在有乔木林，林下有乔灌木藤蔓，地表植被潮湿阴凉，透光度在20%左右，有流水的积水窝附近。平时卧于小树枝上(故又名大睡蛇)，一受惊扰，便从树上跳入水中躲藏。食性复杂，以小青蛙、蚯蚓、蚂蚱、金龟子、蜻蜓、蟑螂等为主。

2002-2004年，科研人员在两广境内进行资源考察，查实两省(区)仅存活800-900条瑶山鳄蜥，为1992年考察统计3000条的30%-20%。面对瑶山鳄濒临灭绝的现实，为了拯救这个世界珍稀物种，在社会各界的关心与支持下，大瑶山保护区与广西师大合作的“瑶山鳄人工繁育与放归大自然实验”以取得成功。

瑶山鳄蜥人工繁育的成功对研究动物进化，物种演变有着重要的学术价值。